Η Ακαδημία Ποδοσφαίρου του Πανδραμαϊκού ξεκίνησε τη λειτουργία της το 2002 με διοικητικό υπεύθυνο τον Ιωάννη Κανελλόπουλο, προπονητή τον Γεώργιο Αμπρικίδη και βοηθό προπονητή τον τότε ποδοσφαιριστή Παύλο Παυλίδη. Οι πρώτες προπονήσεις και οι εντός έδρας αγώνες διεξάγονταν κυρίως στο γήπεδο της Αθηναϊκής Χαρτοποιίας.

Το 2004 διοικητικός υπεύθυνος ανέλαβε ο Παναγιώτης Ευθυβούλης και προπονητής ο Πασχάλης Δημαρίδης. Ένα χρόνο μετά το 2005, επιτεύχθηκε η περαιτέρω ανάπτυξη της Ακαδημίας, με την λειτουργία των ιδιόκτητων αθλητικών εγκαταστάσεων του Πανδραμαϊκού, στον Μυλοπόταμο Δράμας, όπου διεξάγονταν πλέον οι προπονήσεις και οι εντός έδρας συναντήσεις των τμημάτων υποδομής.

Την σεζόν 2009-2010, διοικητικός υπεύθυνος ανέλαβε ένας ακόμη παλαιός ποδοσφαιριστής του συλλόγου, ο Ευστάθιος Μελικίδης, και προπονητές οι Παντελεήμων Καλλιμάνης, Ιωάννης Λυμπερίδης, Χρήστος Κελίδης, Γεώργιος Χατζηδημητρίου, Αθανάσιος Γουδάκης και Δημήτριος Καρβούνης.

Το 2011 η ακαδημία διέθετε 9 ομάδες οι οποίες ήταν οι εξής: 1997-1998, 1999, 1999-2000, 2001, 2002, 2003, 2004 και 2005-2006. Τεχνικός υπεύθυνος ήταν ο Παντελεήμων Καλλιμάνης.

Τα τελευταία χρόνια, προπονητής της ακαδημίας είναι ο πρώην ποδοσφαιριστής της ομάδας, Αναστάσιος Ταντσίδης.

Στο απόγειο της η ακαδημία, είχε περισσότερους από 180 νεαρούς ποδοσφαιριστές, αρκετοί εκ των οποίων αγωνίστηκαν στην πρώτη ομάδα με μεγάλη επιτυχία, κυρίως τη δεκαετία του 2010.

Ένα ακόμα σημαντικό δείγμα της οργάνωσης και της φροντίδας των ποδοσφαιριστών της ακαδημίας, ήταν το γεγονός ότι οι μετακινήσεις των τμημάτων της γίνονταν με ιδιόκτητο λεωφορείο της ομάδας, πράγμα εντυπωσιακό για την πόλη μας αλλά και για όλη τη Βόρεια Ελλάδα.

ΚΑΘΩΣ Η ΕΡΕΥΝΑ ΣΥΝΕΧΙΖΕΤΕ, ΘΑ ΠΡΟΤΙΘΕΝΤΕ ΣΤΑΔΙΑΚΑ ΚΑΙ ΑΛΛΕΣ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΕΣ ΚΑΙ ΔΙΑΚΡΙΣΕΙΣ ΤΗΣ ΑΚΑΔΗΜΙΑΣ ΜΑΣ